我们必须了解，某些引导软件之间存在着或多或少的兼容性问题。而对于接管了我们硬盘引导区的软件，它们的崩溃对于系统来说是致命的，一旦出现这种情况，很可能会造成用户不可弥补的损失。因此，这里强烈建议大家在使用时注意以下几点：
1.不要同时使用多款系统引导软件。在安装此类软件前，请首先确认已经卸载了其他的系统引导软件。
2.建议在安装此类软件时，按照其提示启动恢复盘。
3.建议在每次分区完成后，都进行硬盘分区表的备份工作。这样一旦分区或引导出现异常，我们可以使用分区表恢复功能来抢救系统，减少损失。
System Commander手把手
我们将以System Commander 7.02（以下简称SC）为例，一步一步教读者朋友如何安装多系统，在此之前我们先要作几点说明：
1.SC的操作系统支持列表：
除了以上列表，SC号称支持所有基于PC的操作系统。
2.现在一般能找到的SC 7.02都是Windows安装版，所以在安装前硬盘里至少要有一个Windows操作系统。
3.如果是全新安装，建议用Fdisk进行分区，虽然SC自带的分区工具以及PQMagic之类第三方分区工具功能更强、速度更快，不过兼容性和稳定性不好，将来可能造成分区表被破坏，所以不建议使用。
4.虽然SC可以识别任何它所支持的操作系统的分区格式，但SC自身只能被安装在FAT、FAT32或者NTFS分区之上。
5.硬盘分区规划如下：
以上规划只是为了单纯的多系统安装而定制的，读者可根据自己的情况来规划分区。但要注意：C区一定要分成“4”中要求的格式；硬盘中最多只能有4个主分区（由所有逻辑分区组成的扩展分区算一个主分区）；Fdisk只能划分一个主分区和一个扩展分区；如果没有本地安全性的要求，并且希望各个操作系统间可以共享数据，建议将Win2000及WinXP所在区分为FAT32格式，否则，应该分为NTFS格式。
6.我们将遵循如下的安装顺序（顺序并不会影响最终的安装效果）：Windows 98、SC7.02、Windows Me、Windows 2000、Windows XP、Linux。
好了，已经罗嗦了半天了，让我们赶快开始吧！
系统破坏与修复
一般来说，按本文所介绍的步骤进行操作是不会有任何问题的。但实际上情况是很复杂的，会因为各种各样的原因引起硬盘分区表或引导区的破坏。下面我们就几种常见的情况说明一下修复的方法。
1.非正常卸载SC造成的损坏。由于SC采用了特殊的技术独占主引导区，并且具有很高的优先级，所以当你不在需要SC时，必须按上文中所述的那样进行卸载，否则即使是格式化C区、重装系统甚至重新分区电脑都无法正常引导。如果由于你的疏忽已经造成了这样结果，也不必着急，有两种解决方法：用光盘或者软盘引导系统然后重装SC，再按要求卸载就可以了；如果你实在不想再用SC了，那么还有一个简单的办法，就是在DOS环境下运行命令“fdisk /mbr”，这个命令可以重写主引导记录，使其恢复正常。
2.病毒破坏造成的损坏。这种情况一般用杀毒软件都可以解决，只要用杀毒软盘引导系统，再按杀毒软件的提示杀毒，并修复引导区或分区表即可，像现在国内比较流行的KV300、金山毒霸2002、瑞星2002都有修复硬盘的功能。
3.多种第三方分区及磁盘扫描工具交叉使用造成的损坏，比如：SC的分区工具于PQmagic就有冲突存在，如果你一会儿用SC改变分区，一会儿又用PQmagic，就很容易造成分区表被破坏，虽然很多时候并不影响正常使用，但磁盘扫描工具总会报错又修不好，怎么办？也许你想起了大名鼎鼎的Norton Disk Doctor，用它来试试吧，结果它能发现错误并自动修复，一切看来都很顺利，可当你重启电脑后可怕的事情发生了，分区完全乱了套而且大量数据丢失，情况严重时就只能求助于数据恢复公司了，不过对于个人而言，修复的费用简直是天价，已经够买好几块硬盘了。由于这两类工具种类繁多，所以情况也很复杂，难以穷尽，仅以此实例说明其严重性。没有很好的解决办法，所以应尽量少用这类工具，如果要用就用一个，不要换着试。
其实对于以上三种情况，最好的办法还是防患于未然，在分区一切正常时就备份引导区及分区表，很多杀毒软件和磁盘分区工具都有此功能，下面以金山毒霸2002为例说明一下备份方法：在DOS环境下运行金山毒霸目录中的“KAVFIX.EXE”，出现如图所示界面，在“Tools”菜单栏中选择“Backup Boot Record”即可进行备份。备份的文件大小视硬盘大小而定，一般一张软盘就可以装下，备份文件最好存在软盘或第二块硬盘上，有条件的话刻在光盘上更好。如果就存在当前硬盘上，分区表被破坏时可能会造成该备份文件的丢失，这样备份就失去意义了。
系统启动盘的制作
系统启动盘也叫系统应急盘，它是一旦系统因感染病毒或相关文件损坏等原因而不能直接进入（启动）系统时所要用的软盘，这时如果没有这张小小的软盘，一切修复工作都无法进行，你也就只有望机兴叹、一筹莫展的份了。因此，平时准备一张系统启动盘非常有必要。
一、Windows 95/98/Me 系统启动盘的制作：
Windows 95/98/Me这三个系统的启动盘制作起来比较简单，方法也大致相同，主要有以下3种：
1.在操作系统安装过程的初期，系统将自动询问是否需要在此时创建启动盘，你只要选择需要在此时创建，插入软盘，按照屏幕提示操作就可以了。
2.在运行系统后，打开“控制面板”，双击“添加/删除程序”，然后在出现的“添加/删除程序 属性”的对话框里选择“启动盘”选项，然后插入一张空白的软盘，点击“创建启动盘”，系统就会自动制作启动盘了，这时制作出来的启动盘最完整。我们随后会详细介绍一下它的内容。
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